Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms