Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LHX1P48742 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LHX1P48742 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms