Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MAGEA4P43358 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms