Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PI4KAP42356 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PI4KAP42356 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PI4KAP42356 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms