Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMPOP42166 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMPOP42166 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMPOP42166 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms