Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCR7P32248 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCR7P32248 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms