Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PSMA5P28066 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms