Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CTNNA2P26232 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms