Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ITGA3P26006 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ITGA3P26006 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms