Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PSMA4P25789 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms