Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPREP23469 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPREP23469 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPREP23469 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms