Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA1P20827 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA1P20827 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA1P20827 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms