Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCNA2P20248 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCNA2P20248 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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