Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSPAN8P19075 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms