Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXB4P17483 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXB4P17483 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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