Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTLA4P16410 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTLA4P16410 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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