Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CREB1P16220 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CREB1P16220 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms