Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GP1BBP13224 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms