Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
VPREB1P12018 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms