Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHRNB1P11230 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms