Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms