Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSF2P04141 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSF2P04141 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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