Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24DO94855 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC24DO94855 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SEC24DO94855 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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