Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIA3O75145 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms