Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SETD1AO15047 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms