Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLGNO14967 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLGNO14967 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLGNO14967 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLGNO14967 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms