Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDC7O00311 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC7O00311 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms