Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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