Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E9PBE3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E9PBE3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms