Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C9orf172C9J069 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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C9orf172C9J069 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
C9orf172C9J069 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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