Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOBPA7XYQ1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SOBPA7XYQ1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms