Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF25A6NGN4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF25A6NGN4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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