Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CFAP73A6NFT4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms