Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms