Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms