Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATG4BQ9Y4P1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ATG4BQ9Y4P1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ATG4BQ9Y4P1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ATG4BQ9Y4P1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATG4BQ9Y4P1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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