Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAB39Q9Y376 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms