Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TRAPPC4Q9Y296 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms