Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FAM8A1Q9UBU6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms