Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRIT1Q9P2V4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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