Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
REREQ9P2R6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REREQ9P2R6 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms