Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HCN3Q9P1Z3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HCN3Q9P1Z3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms