Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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