Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PARVAQ9NVD7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms