Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCM2LQ9NUG4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms