Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EMILIN3Q9NT22 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMILIN3Q9NT22 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms