Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SNX15Q9NRS6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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