Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
UBQLN4Q9NRR5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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