Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSU72Q9NP77 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms