Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRDM12Q9H4Q4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms